Odbor lekárskej mikrobiológie

Odbor lekárskej mikrobiológie (OLM) RÚVZ v Banskej Bystrici je laboratórnym pracoviskom, ktoré vykonáva mikrobiologické vyšetrenia klinických vzoriek a mikrobiologické a biologické vyšetrenia zložiek životného prostredia. Činnosť pracoviska je zameraná na ochranu verejného zdravia a poskytovanie včasnej a presnej laboratórnej diagnostiky. OLM pri výkone skúšok uplatňuje systém manažérstva kvality podľa STN EN ISO/IEC 17 025:2018 a STN ISO 15189:2013. OLM je spôsobilé vykonávať mikrobiologické a biologické skúšanie vzoriek životného prostredia ako aj vyjadrovať názory a interpretácie k výsledkom skúšok podľa uvedeného v prílohe k osvedčeniu (rozsah akreditácie (pdf, 7,9 MB)). OLM je spôsobilé vykonávať vyšetrenie klinických vzoriek (rozsah akreditácie medicínskeho laboratória (pdf, 3,9 MB)).

Úsek špeciálnej mikrobiológie

Úsek špeciálnej mikrobiológie vyšetruje vzorky biologického materiálu a podieľa sa na objasňovaní príčin vzniku a šírenia vybraných ochorení bakteriálnej, vírusovej a parazitárnej etiológie. Pri svojej práci používa priame a nepriame metódy dôkazu. Vykonáva základnú diagnostiku pre spádové zdravotnícke zariadenia a nadstavbovú diagnostikou pre oblasť stredoslovenského regiónu. Ďalej zabezpečuje vyšetrovanie vzoriek podozrivých na prítomnosť nebezpečných pôvodcov v súvislosti s mimoriadnymi udalosťami, ktoré by mohli ohroziť verejné zdravie (bioterorizmus). Zhromažďuje a spracováva najnovšie poznatky a informácie v danej problematike. V rámci činnosti národných referenčných centier a špecializovaného pracoviska pre vírusové hepatitídy zabezpečuje nadstavbovú diagnostiku pre potreby ostatných laboratórií zriadených na úradoch verejného zdravotníctva a laboratórií klinickej mikrobiológie rezortu MZ SR. Pracovníci úseku špeciálnej mikrobiológie riešia odborné úlohy mikrobiologického a epidemiologického charakteru. Úzko spolupracujú s odborom epidemiológie pri sledovaní výskytu a šírenia prenosných ochorení. Poskytujú konzultačnú činnosť zdravotníckym zariadeniam a iným laboratóriám, spolupracujú s výskumnými inštitúciami, odbornými vedeckými spoločnosťami a vysokými školami v otázkach diagnostiky a prevencie ochorení mikrobiálnej etiológie.

Rozsah vyšetrenia:

1. Laboratórium virológie:

  • Kultivačné vyšetrenie stolíc, likvorov, výterov zamerané na prítomnosť enterálnych vírusov a adenovírusov
  • Kultivačné vyšetrenie bioptických a pitevných materiálov na prítomnosť enterálnych a chrípkových vírusov
  • Izolácia chrípkových vírusov z výterov krku na bunkových kultúrach a ich následná identifikácia hemaglutinačnou metódou
  • Vyšetrenie rýchlotestom na prítomnosť chrípkových vírusov A a B vo výteroch z krku
  • Kultivačné vyšetrenie odpadových vôd na prítomnosť vírusov Polio 1,2,3 a enterálnych vírusov
  • Vírus neutralizačný test na prítomnosť protilátok proti enterálnym vírusom Polio 1,2,3 a Coxackie B 1-6, A7 a A9

2. Laboratórium sérológie:

  • HIV/AIDS: ELISA HIV Ab-Ag
  • Chrípka typ A a B: ELISA IgM, IgG
  • Rubeola: ELISA IgM, ELISA IgG, avidita IgG
  • SARS-CoV-2: ELISA IgG, IgA, IgG kvantitatívne
  • Vírusové hepatitídy: ELISA anti-HAV, ELISA IgM HAV, ELISA HBeAg, ELISA anti-HBe, ELISA anti-HBs, ELISA HBsAg, ELISA HBsAg konfirmácia, ELISA anti-HBc, ELISA IgM HBc, ELISA anti-HCV, Western-blot IgG HCV ELISA, Western-blot IgG/IgM HEV
  • B. pertussis a B. parapertussis: ELISA IgG, IgA, aglutinácia
  • Toxoplasma gondii: celkové protilátky KFR, ELISA IgG, IgM, IgA, IgE, avidita IgG, Western-blot IgG
  • Kultivácia Bordetella pertussis a Bordetella parapertussis

3. Laboratórium molekulárnej biológie:

  • Adenovirus: PCR
  • Chrípka typ A (subtypy A/H1, A/H3, A/H1N1 pandemická), typ B: RT-PCR, real-time PCR
  • RSV: RT-PCR
  • SARS-CoV-2: RT-PCR
  • Enterovírusy: RT-PCR
  • Bordetella pertussis: real-time PCR (vrátane dôkazu génu zodpovedného za tvorbu toxínu ptX)
  • Bordetella parapertussis: real-time PCR, PFGE
  • Streptococcus pneumoniae: PCR, real-time PCR, sérotypizácia (sérologické a molekulárno-biologické metódy), PFGE
  • Francisella tularensis: PCR, real-time PCR
  • Vibrio cholerae: PCR
  • Campylobacter jejuni: PCR, PFGE
  • Clostridium perfringens: PCR
  • Toxoplasma gondii: PCR, real-time PCR
  • Naegleria fowleri: real-time PCR
  • dôkaz prítomnosti nukleových kyselín klostrídií produkujúcich botulínový neurotoxín typu A, B, E, F

Úsek mikrobioloógie a biológie životného prostredia

Úsek mikrobiológie a biológie životného prostredia zabezpečuje komplexné analýzy vzoriek životného a pracovného prostredia (vody, potraviny, predmety bežného užívania, vnútorné a vonkajšie ovzdušie). Predmetom skúmania sú mikrobiologické a biologické ukazovatele, ktoré ovplyvňujú hygienickú kvalitu životného prostredia a majú dopad na zdravotný stav populácie. Metódy práce sú stanovené v platných technický normách (STN, STN ISO, STN EN), Potravinovom kódexe, vyhláškach, nariadeniach a odborných usmerneniach MZ SR. Výsledky analýz slúžia terénnym oddeleniam ako podklad k ich kontrolnej a rozhodovacej činnosti. Laboratóriá úseku mikrobiológie a biológie životného prostredia poskytujú analýzy aj iným zákazníkom formou platených služieb. V rámci špecializovanej činnosti vykonávajú diagnostiku prítomnosti alergénov roztočov v prachu, monitorujú výskyt biologických alergénov v ovzduší a zabezpečujú koordináciu činnosti monitorovacích staníc peľovej informačnej služby pri RÚVZ v SR a celoslovenského peľového spravodajstva.

Rozsah vyšetrenia:

1. Laboratórium mikrobiológie potravín a predmetov bežného užívania:

  • celkový počet mikroorganizmov
  • koliformné baktérie
  • Staphylococcus aureus a koaguláza pozitívne stafylokoky
  • Escherichia coli
  • Salmonella
  • mezofilné anaeróbne sporulujúce mikróby
  • Listeria monocytogenes
  • enterokoky
  • kvasinky a plesne
  • potenciálne toxinogénne plesne
  • plesne iné než Geotrichum candidum
  • Bacillus cereus
  • Enterobacteriaceae
  • stanovenie počtu slizotvorných baktérií rodu Leuconostoc
  • Pseudomonas aeruginosa
  • rod Vibrio parahaemolyticus
  • iné patogénne a podmienene patogénne mikroorganizmy

2. Laboratórium mikrobiológie vôd:

  • koliformné baktérie
  • Escherichia coli
  • enterokoky
  • kultivovateľné mikroorganizmy pri t = 22 a 36 °C
  • Pseudomonas aeruginosa
  • sulfit redukujúce črevné sporulujúce anaeróbne baktérie
  • Staphylococcus aureus
  • Salmonella
  • iné patogénne a podmienene patogénne mikroorganizmy

3. Laboratórium na kontrolu sterility, dezinfekcie a prevencie nákaz:

  • sterilita predmetov a sterilných materiálov
  • mikrobiologická kontaminácia vnútorného ovzdušia
  • účinnosť sterilizačných prístrojov s využitím bioindikátorov
  • účinnosť dezinfekčných roztokov
  • účinnosť dezinfekčných procesov
  • vyhľadávanie faktorov prenosu nákazy

4. Laboratórium biológie:

  • abiosestón
  • živé organizmy
  • mŕtve organizmy
  • bezfarebné bičíkovce
  • železité a mangánové baktérie
  • mikromycéty stanoviteľné mikroskopicky
  • vláknité baktéria
  • producenty
  • konzumenty
  • cyanobaktérie (sinice)
  • riasy - stanovenie taxonomických skupín alebo taxónov
  • stanovenie makrofytov
  • kultivačné stanovenie améb vo vodách alebo steroch
  • helmintologické vyšetrenie detských pieskovísk
  • determinácia škodcov v potravinách
  • determinácia cudzopasného alebo obťažujúceho hmyzu vo vnútornom prostredí budov
  • prítomnosť alergénov roztočov v prachu
  • monitorovanie a diagnostika biologických alergénov v ovzduší
  • peľové spravodajstvo v SR

Integrálnou súčasťou odboru lekárskej mikrobiológie sú:

Národné referenčné centrum pre pertussis a parapertussis

Národné referenčné centrum pre toxoplazmózu

Národné referenčné centrum pre pneumokokové a hemofilové nákazy

Informačné centrum pre bakteriologické (biologické) a toxínové zbrane

Špecializované pracovisko pre vírusové hepatitídy

Špecializované pracovisko pre diagnostiku Clostridium botulinum v potravinách a klinickom materiáli